А если все будем удалять из УС то ручные сопоставления собьются или останутся?
Ручные сопоставления товаров привязываются к уникальному числовому коду товара в учётной системе, соответственно, если код товара будет без изменений, тогда сопоставления (связи с товарами поставщиков) сохранятся. Уникальный числовой код товара может измениться, если например случайно удалить товар в админ части интернет-магазина и создать его заново, т.е. наименование товара будет таким же, но уникальный числовой код будет уже другим.